Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem87bQ8BKU8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms