Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms