Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms