Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pcsk9Q80W65 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pcsk9Q80W65 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pcsk9Q80W65 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pcsk9Q80W65 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pcsk9Q80W65 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pcsk9Q80W65 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pcsk9Q80W65 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pcsk9Q80W65 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pcsk9Q80W65 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pcsk9Q80W65 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pcsk9Q80W65 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pcsk9Q80W65 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pcsk9Q80W65 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pcsk9Q80W65 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pcsk9Q80W65 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Pcsk9Q80W65 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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