Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms