Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms