Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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