Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms