Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms