Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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SrmQ64674 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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SrmQ64674 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms