Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms