Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms