Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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AtmQ62388 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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