Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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SspnQ62147 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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SspnQ62147 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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SspnQ62147 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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SspnQ62147 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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SspnQ62147 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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SspnQ62147 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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SspnQ62147 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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SspnQ62147 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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SspnQ62147 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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SspnQ62147 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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SspnQ62147 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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SspnQ62147 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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