Protein–RNA interactions for Protein: Q61624

Znf148, Zinc finger protein 148, mousemouse

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Length 794 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf148Q61624 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf148Q61624 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf148Q61624 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf148Q61624 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf148Q61624 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf148Q61624 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf148Q61624 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Znf148Q61624 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Znf148Q61624 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Znf148Q61624 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Znf148Q61624 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Znf148Q61624 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Znf148Q61624 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Znf148Q61624 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Znf148Q61624 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Znf148Q61624 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Znf148Q61624 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Znf148Q61624 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Znf148Q61624 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf148Q61624 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms