Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BcanQ61361 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms