Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms