Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms