Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms