Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms