Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nr2f1Q60632 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms