Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Vmn1r223Q5SSA0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r223Q5SSA0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r223Q5SSA0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r223Q5SSA0 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r223Q5SSA0 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r223Q5SSA0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r223Q5SSA0 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r223Q5SSA0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r223Q5SSA0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r223Q5SSA0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r223Q5SSA0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r223Q5SSA0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r223Q5SSA0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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