Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mdc1Q5PSV9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mdc1Q5PSV9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms