Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms