Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Tmem253Q3UNB8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Tmem253Q3UNB8 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Tmem253Q3UNB8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Tmem253Q3UNB8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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