Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms