Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms