Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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Rnf180Q3U827 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Rnf180Q3U827 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Rnf180Q3U827 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Rnf180Q3U827 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Rnf180Q3U827 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Rnf180Q3U827 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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