Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U595 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U595 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U595 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U595 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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