Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms