Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ctdnep1Q3TP92 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ctdnep1Q3TP92 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ctdnep1Q3TP92 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ctdnep1Q3TP92 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ctdnep1Q3TP92 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ctdnep1Q3TP92 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ctdnep1Q3TP92 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ctdnep1Q3TP92 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ctdnep1Q3TP92 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ctdnep1Q3TP92 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ctdnep1Q3TP92 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ctdnep1Q3TP92 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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