Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Samd11Q1RNF8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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Samd11Q1RNF8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Samd11Q1RNF8 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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