Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
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Rpusd2Q149F1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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