Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3ip1Q149C2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms