Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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