Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms