Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc4Q08624 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc4Q08624 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc4Q08624 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc4Q08624 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc4Q08624 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc4Q08624 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc4Q08624 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc4Q08624 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc4Q08624 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc4Q08624 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc4Q08624 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc4Q08624 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc4Q08624 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc4Q08624 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc4Q08624 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms