Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnma1Q08460 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnma1Q08460 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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