Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm3Q08189 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms