Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
F13bQ07968 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms