Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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MestQ07646 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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MestQ07646 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MestQ07646 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
MestQ07646 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
MestQ07646 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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MestQ07646 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MestQ07646 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MestQ07646 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MestQ07646 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MestQ07646 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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MestQ07646 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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MestQ07646 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MestQ07646 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MestQ07646 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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MestQ07646 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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MestQ07646 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MestQ07646 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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MestQ07646 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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MestQ07646 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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MestQ07646 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MestQ07646 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms