Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms