Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm29794-201ENSMUST00000218919 1247 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Siah2Q06986 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms