Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms