Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm37154-201ENSMUST00000192266 1290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Defb6-201ENSMUST00000063112 323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms