Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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NfiaQ02780 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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NfiaQ02780 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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