Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms