Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms