Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms