Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms